记忆风暴没有绝对通吃的最佳副本，但如果只看烙印泛用性，优先选择印象畸点；如果队伍缺少破核、治疗或拦怪能力，则残响畸点的收益更高，记忆畸点更适合补充回能、召唤和常规治疗。三个副本的核心差异不在敌人强度，而在掉落烙印不同，因此应先看队伍缺什么，再决定把每日次数投入哪里。烙印本每天提供3次挑战机会，额外消耗异方晶购买次数并不划算。
印象畸点适合大多数新手和中期玩家，首要目标是调律·零、牧者和造物。调律·零是能量套的一号位组件，通常与残响畸点的希望、记忆畸点的回廊空响组成“调律·零＋希望＋回廊空响”，适合需要频繁开大、能量需求高或暂时没有更强输出烙印的角色；牧者更适合辅助，在权能充足时可利用破核前后的释放节奏延长增益；造物则优先给夏音、科希等召唤体系角色。若队伍没有明确的功能需求，优先刷印象畸点最不容易浪费体力。
残响畸点适合攻坚期和低练度队伍，优先级最高的是复乐园、以血为凭、铁臂信条和希望。复乐园能补足队伍的破核次数，通常给盾辅或抗伤位携带，一套已经能覆盖多数关卡，只有队伍经常同时面对多名核心敌人时才考虑第二套；以血为凭用于强化治疗，长线关卡和高压关卡的价值明显高于普通输出烙印；铁臂信条适合坚韧或狂暴角色拦截敌人，遇到占用多个阻挡位的敌人时更有用；希望则是能量套的二号位，队伍中没有能量条或不依赖必杀技的角色，不必为了凑套强行刷取。
记忆畸点适合需要大量回能、召唤法伤或稳定治疗的队伍，重点关注回廊空响、棺中物和终幕之序章。回廊空响既能组成能量套，也能作为三号位通用替补，基础攻击速度属性对多数输出角色都有实际收益；棺中物优先给法伤召唤角色，三号位可与造物或回廊搭配；终幕之序章适合哈梅尔、艾瑞尔等治疗角色，在尚未获得以血为凭时足够承担主力治疗任务。单纯为了暴击、控制或低频特殊效果刷这个副本，收益通常不如先补回能和治疗组件。
具体选择可以按队伍阶段执行：开荒队先刷印象畸点，目标是至少做出一套能量组合，再根据主力角色补牧者或造物；卡在核心怪、破核次数不足时转刷残响畸点，先做一套复乐园；前排容易倒下时优先以血为凭或铁臂信条；拥有成熟输出体系后，再回到记忆畸点补第二套回廊、棺中物或终幕之序章。平时掉落以随机为主，不要因为一次没有目标烙印就消耗大量异方晶反复刷新；遇到自选副本或自选箱时，优先补齐复乐园和牧者，之后再集中获取回廊空响。
